החטיבה באגרואינפורמטיקה, מצורפת לחוגי הלימוד השונים בפקולטה שלנו ומכשירה קבוצה קטנה ואיכותית של סטודנטים בעלי רקע מתמטי טוב בכישורים של מתמטיקה, תכנות וניתוח נתונים מתקדם בנוסף על חוג האם. על הסטודנט לקחת את כל קורסי החובה של חוג האם (כמעט כל חוגי האם האפשריים בפקולטה שלנו) אך במקום כ 32-45 נקודות של קורסי בחירה בחוג האם (תלוי חוג), יש לקחת קורסי מתמטיקה מורחבים, קורסי תכנות וקורסים נוספים של חטיבת האגרואינפורמטיקה הכוללים למשל מעבדה באגרוטק, ביואינפורמטיקה, עיבוד נתונים, מודלים מתמטיים, עיבוד תמונה וגנומיקה. כל הקורסים הם בתוך הפקולטה לחקלאות ברחובות. בוגרי החטיבה, בשל הכשרתם המגוונת והיכולת לנתח נתונים רבים, מבוקשים בתעשית האגרוטק, הביוטק והפודטק ובמעבדות מחקר בסיסי באוניברסיטאות יותר מאשר בוגרי החוגים הרגילים. בנוסף, מכיוון שמדובר בקבוצה קטנה ואיכותית אנו מארגנים לחבריה פעילויות ייחודיות מדי פעם כגון סיורים והרצאות מחברות ביוטק ואגרוטק וביקורים במעבדות המחקר השונות ברחבי הפקולטה. חלק מהסטודנטים בוחרים לעשות פרויקטי גמר במעבדות מחקר. אחוז יחסית גבוה בוחר להמשיך לתואר שני מחקרי. החל משנת הלימודים תשפ"א לבוגרי החטיבה יוענק תואר "בוגר במדעי החקלאות" בו יצוין שם החוג הראשי.  החטיבה ב"אגרואינפורמטיקה" תצוין רק באישור הלימודים והציונים ולא תופיע בתעודה.