במסלול המחקרי  (א') נדרשים התלמידים ללמוד תכנית לימודים בהיקף של 32-46 נ"ז, אשר מורכבת מלימודי השלמה*, לימודי חובה, סמינר וקורסי בחירה.

התלמידים לומדים במכון במשך שנתיים אקדמיות (4 סמסטרים) כאשר כבר במהלך השנה השנייה מתחילים לגבש את עבודת התיזה, בעזרת סגל המכון.
לרוב כתיבת העבודה ממשיכה בשנה השלישית.

*מכסת לימודי ההשלמה נקבעת עבור כל תלמידי באופן אישי בהתאם ללימודיו לבוגר.