. המדור המקראי. מי שבוחר את המדור המקראי כמדור ראשי צריך לקחת בשנים ב' ו-ג' סה"כ 22 נ"ז. 14 נ"ז קורסי חובה (כולל 4 נ"ז של עבודה סמינריונית) + 8 נ"ז קורסי בחירה במדור. מי שבוחר במדור המקראי כמדור משני צריך לקחת סה"כ 8 נ"ז מתוך לימודי החובה והבחירה של המדור. להלן קורסי החובה במדור בשנה ב':

. מי שמבקש לקבל תעודת חופר חייב ללמוד קורס 43110 בשנה ב' או ג'. הקורס ניתן פעם בשנתיים."

. המדור הקלאסי. על מי שבוחר במדור הקלאסי כמדור ראשי חייב לקחת סה"כ 22 נ"ז (כולל 4 נ"ז של עבודה סמינריונית), מתוכם 16 נ"ז חובה + 6 נ"ז קורסי בחירה בשנים ב' ו-ג'. מי שבוחר במדור הקלאסי כמדור משני צריך ללמוד סה"כ 8 נ"ז בשנים ב' ו-ג'. 4 נ"ז קורס 43511, 2 נ"ז 43523, ו-2 נ"ז נוספים קורס בחירה מבין קורסי המיומנויות של המדור: נומיסמטיקה, אפיגרפיה או כלי חרס. (את הסמינר - קורס 43526, חובה לקחת בשנה ג' להלן קורסי החובה בשנים ב'-ג':

. החל משנה ב' בוחרים את מדור ההתמחות + מדור משני שבו לוקחים קורסים בודדים. במדור הראשי ניתן לבחור בין המדורים הבאים: פרהיסטורי, מקראי או קלאסי. במדור המשני ניתן לבחור בין המדורים הבאים: פרהיסטורי, מקראי, קלאסי, מוסלמי או אשורולוגי בשנה ג' חובה לקחת את הסמינריון במדור הראשי (4 נ"ז) +עבודה סמינריונית (4 נ"ז) + מבוא לארכאוזואולוגיה (2 נ"ז). סה"כ נ"ז חובה במדור הפרהיסטורי לשנה ג' = 10 נ"ז