נקודות זכות באוניברסיטה העברית: 4

תואר: מוסמך

היחידה האקדמית שאחראית על הקורס: מדעים ביורפואיים

סמסטר: סמסטר ב'

שפת ההוראה: אנגלית

קמפוס: עין כרם

מורה אחראי על הקורס (רכז): פרופ יעל שטרן-באך
ד"ר עמליה טביב

דוא"ל של המורה האחראי על הקורס: yael.stern-bach@mail.huji.ac.il

שעות קבלה של רכז הקורס: בתאום דרך דוא"ל

מורי הקורס:
ד"ר שעיה לב,
ד"ר אורי שלו,
פרופ יעל שטרן-באך,
פרופ מיכאל ברגר,
פרופ איל בן-צבי,
ד"ר ליאור ניסים,
ד"ר שי סבח,
ד"ר חנן שופמן,
מר יואל ירץ פרץ,
מר אור ראובן,
מר מאיר אזגורי,
ד"ר יריב מרון

תאור כללי של הקורס:
הקורס יהווה הכשרה רחבה לתלמידי מסטר בחשיפה לשיטות מחקר מתקדמות במהלכו יחשפו התלמידים למגוון גישות מחקריות ושיטות וכן יכירו את המכשור המתקדם העומד לרשותם במסגרת היחידה לציוד בין-מחלקתי. במסגרת הקורס ילמדו העקרונות התיאורטיים העומדים בבסיס כל שיטה ומכשיר ואת יישומיהם במחקרים ביו-רפואיים. הרקע האקדמי איתו מגיעים סטודנטים מתארים ראשונים יתורגם ליכולות מחקריות פרקטיות אשר יביאו את תלמידי המסטר לנקודת פתיחה מחקרית ייחודית. התלמידים יכירו את יכולות התמיכה של תשתיות המחקר בפקולטה, יהיו מודעים למגוון האפשרויות המחקריות העומדות בפניהם הן במעבדות המחקר של כל אחד ואחת מהם והן מעבר לכך במסגרת מחקר נרחב המתנהל בפקולטה. התלמידים ישלטו ברמה גבוהה ברקע התאורטי וכן יגיעו לשליטה ברמה בסיסית בכל אחת מהגישות שיוצגו.

מטרות הקורס:
חשיפה של הסטודנטים למגוון גישות מחקריות, שיטות ומכשור מדעי ויישומם במחקר ביו-רפואי. הכרת תשתיות המחקר בפקולטה. שליטה ברמה גבוהה ברקע התאורטי וכן שליטה ברמה בסיסית בכל אחת מהגישות שיוצגו.

תוצרי למידה :
בסיומו של קורס זה, סטודנטים יהיו מסוגלים:
לבחון שאלת מחקר לאור גישות מחקר מתקדמות. לתכנן מערכת ניסויית תוך שימוש בגישות מחקריות שונות. להתאים גישה/מיכשור הולמים לשאלה מחקרית. לשלוט ברמה גבוהה ברקע התאורטי וכן שליטה ברמה בסיסית בכל אחת מהגישות שיוצגו. כל זאת לצורך הכוונתם בעתיד לשימוש בגישות במחקריהם השונים במהלך המסטר.

דרישות נוכחות (%):
60%

שיטת ההוראה בקורס: הרצאות פרונטליות, סדנאות ותרגילים,

רשימת נושאים / תכנית הלימודים בקורס:
1. גישות הדמייה ומיקרוסקופיה:
מבוא: ספקטרום קרינה אלקטרומגנטית והאור הנראה
האור כגל ותכונותיו- אורך גל (ורמת האנרגיה), אמפליטודה, פאזה. היכרות עם תשתיות הדמייה בפקולטה, כולל חשיפה ליחידת מקרוסקופיית אור, יחידת מקרוסקופיית אלקטרונים, אנליזות תמונה, ספקטרופוטומטריה ומרכז ווהל להדמייה של מודלים פרה-קלניים הכוללים MRI/PET/CT אולטרסאונד וIVIS.

• מיקרוסקופית אור נראה:
Bright field
Phase contrast

• מיקרוסקופיה פלורוסנטית:
Fluorescent microscope
Confocal microscope
Time lapse microscopy
Super Resolution – STORM
Super Resolution – STED

• מיקרוסקופית אלקטרונים:
Transmission Electron Microscope (TEM)
Scanning Electron Microscope (SEM)

2. Flow cytometry & FACS
עיקרון הפעולה: מרכיבי ה- FACS (לייזר, אופטיקה, זרימה, וסוגי הדיטקטורים).
הסיגנלים המתקבלים- A, W, H.
פרוטוקולים, ניתוח תוצאות והצגתם.
עקרון ה-sorting ושימושים במחקר



3. ביולוגיה מולקולרית
• שיטות ריצוף
השיטה הקלאסית – Sanger, next generation sequencing
• היכרות עם טכנולוגיית אנליות בתאים בודדים (single cell)
בתפר שבין הפרדת תאים בודדים בעזרת FACS לאפליקציות גנומיות כולל חשיפה לשיטות ריצוף, תוצג גישת הsingle cell. יוצגו שיטות הפרדה נוספות כגון מקירופלואידיקה (10X Genomics) וכדומה.

• Amplification & quantitation methods
qPCR& PCR
LAMP
MDA & WGA
• Gene manipulation
KD
shRNA siRNA, miRNA
KO, KI,
קלאסית, Crispr
שיטות לאקטיבציה של גנים
עכברים טרנסגנים
מערכות inducible – Cre, ER טמוקסיפן
כולל חשיפה ליחידה לעכברים טרנסגנים (GEEM) ברשות למודלים ביולוגים וקדם קליניים.

• שיטות באפיגנטיקה –
ChIP,Cut & run, Bisulftite, RRBS
• גנומיקה –
Chromosome Conformation Capture HiC, 4C, 3C

4. חלבונים- שיטות הפרדה
Western Blot
Co-IP
MassSpec
כולל חשיפה ליחידה לפרוטאומיקה/מטבולומיקה.

חומר חובה לקריאה:
1. Molecular Biology of1. Molecular Biology of The Cell, Alberts et al., 6th ed. 2014-
2. Essential Cell Biology, Alberts et al., 5nd Ed. 2019.
3. Molecular Cell Biology, Lodish et al, 8th Ed, 2016
4. Genes XI, Lewin, 2012

חומר לקריאה נוספת:

מרכיבי הציון הסופי :
מבחן ממוחשב בחוות המחשבים % 70
מטלות הגשה במהלך הסמסטר: תרגילים / עבודות / מבדקים / דוחות / פורום / סימולציה ואחרות % 30

מידע נוסף / הערות:
נוכחות לא מוצדקת של פחות מ-60% לא תאפשר לגשת למבחן הסופי.