נקודות זכות באוניברסיטה העברית: 6

תואר: בוגר

היחידה האקדמית שאחראית על הקורס: מדעים ביורפואיים

סמסטר: סמסטר ב'

שפת ההוראה: אנגלית ועברית

קמפוס: עין כרם

מורה אחראי על הקורס (רכז): יורם בן שאול ודני רוקני

דוא"ל של המורה האחראי על הקורס: dan.rokni@mail.huji.ac.il, yoramb@ekmd.huji.ac.il

שעות קבלה של רכז הקורס:

מורי הקורס:
ד"ר יורם בן-שאול,
ד"ר דן רוקני,
גב נוגה לארי,
מר מתן קיין

תאור כללי של הקורס:
בקורס זה נלמד מגוון שיטות להצגה וניתוח של נתונים, וכן כלים לכתיבת סימולציות וממשקים לבניית ניסויים. שפת התכנות שבה נשתמש היא MATLAB, ואת הדוגמאות שלנו ניקח בעיקר מתחום המחקר שלנו, נוירוביולוגיה, אך הידע שיירכש בקורס זה יהיה שימושי גם לתחומי מחקר אחרים שבהם נאסף מידע כמותי. הקורס מניח ודורש רקע בסיסי בתכנות, אבל נתחיל מההתחלה, ונתקדם מהר. הידע יהיה ספציפי ל MATLAB אבל את רוב החומר ניתן יהיה ליישם בקלות גם עם שפות תכנות אחרות. דרישה מוקדמת נוספת היא קורס בסיסי בנוירוביולוגיה.
הקורס יכלול הרצאות רקע פרונטליות, הרצאות מול מחשב עם תכנות במהלך השיעור, ותרגולים

מטרות הקורס:
מטרת הקורס היא להקנות כלים לעיבוד וניתוח יעילים של נתונים בביולוגיה עם דגש על נוירוביולוגיה. אמנם יישנן תוכנות מסחריות שמטרתן היא עיבוד נתונים, אך טובות ככל שיהיו, הן מוגבלות לאותן אנליזות שלשמן נכתבו. החופש לשאול ולענות על שאלות מדעיות בנוירוביולוגיה (ובכל תחום אחר שבו יש עיבוד מידע) דורש יכולת בתכנות.

תוצרי למידה :
בסיומו של קורס זה, סטודנטים יהיו מסוגלים:
להגדיר בעיות של עיבוד וניתוח נתונים ולפתור אותן במטלב.
כמו כן, כתוצר לוואי, – התלמידים ירכשו הכרות מעמיקה עם היבטים חישוביים של מערכת העצבים

דרישות נוכחות (%):
100

שיטת ההוראה בקורס: הרצאות בכתה, הרצאות בכתת מחשבים, תרגול

רשימת נושאים / תכנית הלימודים בקורס:
1. סוגי סיגנלים בנוירוביולוגיה
2. סביבת העבודה של מטלב
3. כתיבת סקריפטים בסיסיים
4. כתיבת פונקציות
5. מבני נתונים ומשתנים
6. אנליזות של פוטנציאלי פעולה מנוירון בודד
7. גרפיקה במטלב
8. ממשקים אינטראקטיביים במטלב
9. תיאוריית האינפורמציה
10. אניליזות של פוטנציאלי פעולה מאוכלוסיות של נוירונים
11. שליטה בניסוי וקריאת נתונים במטלב
12. אנליזות של דימות אופטי

חומר חובה לקריאה:
אין

חומר לקריאה נוספת:

הערכת הקורס - הרכב הציון הסופי :
מבחן מסכם בכתב/בחינה בעל פה 0 %
הרצאה0 %
השתתפות 0 %
הגשת עבודה 70 %
הגשת תרגילים 30 %
הגשת דו"חות 0 %
פרויקט מחקר 0 %
בחנים 0 %
אחר 0 %

מידע נוסף / הערות:
פתוח לתלמידי רפואה שנה ג', ופתוח לתלמידים מתקדמים על בסיס מקום פנוי
הקורס יהיה מוגבל לפי כמות התלמידים שיכולים להיכנס לכתת המחשבים בביה"ס לרפואה