נקודות זכות באוניברסיטה העברית: 3

תואר: בוגר

היחידה האקדמית שאחראית על הקורס: מדעי המחשב וביולוגיה חישובית

סמסטר: סמסטר א'

שפת ההוראה: עברית

קמפוס: קרית א"י ספרא

מורה אחראי על הקורס (רכז): ד״ר תומי קפלן

דוא"ל של המורה האחראי על הקורס: tommy@cs.huji.ac.il

שעות קבלה של רכז הקורס: ראשון 9-10 או בתיאום מראש

מורי הקורס:
ד"ר תומי קפלן
גב מוריאל נועה

תאור כללי של הקורס:
מבוא לשיטות חישוביות לניתוח רצפים ביולוגים

מטרות הקורס:
הבנה של עקרונות מנחים לפיתוח שיטות, אלגוריתמים וכלים לפתרון בעיות ביולוגיות בשיטות חישוביות.

תוצרי למידה :
בסיומו של קורס זה, סטודנטים יהיו מסוגלים:
התלמידים יהיו מסוגלים להבין כיצד לנסח בעיות ביולוגיות באופן מתמטי פורמלי, לנסח פתרונות אלגורתמיים וסטטיסטיים לבעיות אלו תחת עקרונות נראות מקסימלית ושערוך בייסיאניים.

דרישות נוכחות (%):
100

שיטת ההוראה בקורס: הרצאה פרונטלית

רשימת נושאים / תכנית הלימודים בקורס:
עימוד רצפים, תכנון דינמי, מודלים הסתברותיים של סדרות. שרשראות מרקוב, Hidden Markov Models. שיטות לניתוח עצים פילוגנטיים. הסקה בייסיאנית.

חומר חובה לקריאה:
Biological Sequence Analysis, by Durbin et al.

חומר לקריאה נוספת:
אין

הערכת הקורס - הרכב הציון הסופי :
מבחן מסכם בכתב/בחינה בעל פה 30 %
הרצאה0 %
השתתפות 0 %
הגשת עבודה 0 %
הגשת תרגילים 50 %
הגשת דו"חות 0 %
פרויקט מחקר 0 %
בחנים 0 %
אחר 20 %
סיכומים והשתתפות

מידע נוסף / הערות:
אין