נקודות זכות באוניברסיטה העברית: 3

תואר: מוסמך

היחידה האקדמית שאחראית על הקורס: גנטיקה והשבחה

סמסטר: סמסטר א'

שפת ההוראה: עברית

קמפוס: רחובות

מורה אחראי על הקורס (רכז): פרופ אורי לביא

דוא"ל של המורה האחראי על הקורס: ulavi@agri.gov.il

שעות קבלה של רכז הקורס: תמיד

מורי הקורס:
פרופ אורי לביא,
ד"ר גיורא בן-ארי

תאור כללי של הקורס:
הקורס מתמקד בתיאור הפולימורפיזם ברמה הפנוטיפית והגנוטיפית, בשיטות לאפיונו וביישומיו. הנושאים שידונו בקורס כוללים: סוגים שונים של סמני DNA. הבסיס הגנטי ליישום סמני DNA. הערכת שונות גנטית ומרחקים גנטיים בין ובתוך אוכלוסיות. שימוש בסמני DNA לזיהוי פרטים, אוכלוסיות ומינים. שיטות לקביעה רבת-היקף ((high throughput של הגנוטיפים באמצעות סמני DNA. עקרונות ניתוחי תאחיזה. מבנים גנטיים של אוכלוסיות מיפוי. בניית מפות גנטיות. יישומים של סמני DNA לזיהוי פלילי, אבחון מחלות, השבחה ואיתור גנים. שיטות סטטיסטיות למיפוי גנטי. שימוש במאגרי-מידע של רצפי DNA ודגמי ביטוי של גנים. שיטות לריצוף גנומי ושימוש במפות גנומיות השוואתיות. איתור גנים בדידים ואתרים המשפיעים על תכונות כמותיות (QTLs). ניתוחי אסוציאציה כלל-גנומיים בין סמנים לגנים (GWAS). חישוב מובהקות סטטיסטית בניתוחים המבוססים על ריבוי השוואות. סלקציה גנומית.

מטרות הקורס:
אפיון ותיאור השונות הקיימת ברצפי הדנ"א.
הצגת הכלים המשמשים לאפיון השונות בדנ"א.
דיון ביישומים של השונות בדנ"א בתחומי הזיהוי ואיתור גנים הן למטרות חקלאיות והן למטרות רפואיות.
הצגת שיטות שונות לאיתור גנים.
הדגמה של מאגרי מידע ותוכנות שונות המשמשות לאיתור השונות בדנ"א וליישומיה.

תוצרי למידה :
בסיומו של קורס זה, סטודנטים יהיו מסוגלים:
הכרת שיטות המשמשות לאפיון שונות גנטית ב-.DNA
שימוש בתוכנות שונות לאיתור השונות בDNA.
זיהוי פרטים ואוכלוסיות, הערכה כמותית של שונות גנטית ובניית עצים פילוגנטיים.
יישום השיטות הנלמדות בקורס

דרישות נוכחות (%):
100

שיטת ההוראה בקורס: הרצאה פרונטלית + תרגיל שבועי בכיתת מחשבים.

רשימת נושאים / תכנית הלימודים בקורס:
1. מבוא- פולימורפיזם, תאחיזה גנטית, סמני DNA.
2.סמנים רב-אתריים.
3. סמנים חד-אתריים (SSR ו-(SNP.
4.זיהוי פרטים ואוכלוסיות, הערכת שונות גנטית ובניית עצים פילוגנטיים.
5.תשתיות גנומיות.
6. LOD-Score, נראות מירבית, איתור גנים בודדים.
7.איתור QTL, QTG ו-QTN
8.יישומים ומגבלות של השונות ב.DNA
9.איתור גנים באמצעות שונות בדנ"א.
10.שימוש בשבבי DNA וב-.Deep Sequencing
11.אימות QTL, ניתוח רגרסיה לאומדן השפעת QTL, חישוב .FDR
12. מיפוי גנטי ופיזיקלי.
13.גישות חדשניות לאיתור גנים.

חומר חובה לקריאה:
מדי שנה מתקיים דיון במאמר מדעי אחד (בכל שנה מאמר עדכני אחר), אותו יש חובה לקרוא.

חומר לקריאה נוספת:
באתר הקורס

הערכת הקורס - הרכב הציון הסופי :
מבחן מסכם בכתב/בחינה בעל פה 70 %
הרצאה0 %
השתתפות 0 %
הגשת עבודה 0 %
הגשת תרגילים 15 %
הגשת דו"חות 0 %
פרויקט מחקר 0 %
בחנים 15 %
אחר 0 %

מידע נוסף / הערות:
אין